Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn1Q62261 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms