Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms