Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a1Q61165 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms