Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TmpoQ61033 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms