Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp7Q60973 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp7Q60973 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms