Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik1Q60934 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms