Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mkrn3Q60764 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn3Q60764 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms