Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd4Q60688 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms