Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik1Q60670 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms