Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm1Q60636 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm1Q60636 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms