Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3aQ60520 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms