Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf123Q5XPI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms