Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms