Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm27Q5SFM8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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