Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1F6

Trav5d-4, T cell receptor alpha variable 5D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5d-4Q5R1F6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav5d-4Q5R1F6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav5d-4Q5R1F6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms