Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810065E05RikQ5NC41 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms