Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms