Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp22Q5DU02 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms