Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf608Q56A10 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Znf608Q56A10 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf608Q56A10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms