Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GpkowQ56A08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpkowQ56A08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms