Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spire1Q52KF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms