Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnl1Q52KE7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms