Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem171Q4KL18 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms