Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Esf1Q3V1V3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Esf1Q3V1V3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Esf1Q3V1V3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Esf1Q3V1V3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Esf1Q3V1V3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Esf1Q3V1V3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Esf1Q3V1V3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Esf1Q3V1V3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Esf1Q3V1V3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms