Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms