Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsf3Q3URE1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsf3Q3URE1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsf3Q3URE1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsf3Q3URE1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Acsf3Q3URE1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Acsf3Q3URE1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms