Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms