Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc4Q3UP24 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms