Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330014E10RikQ3UL33 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E330014E10RikQ3UL33 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms