Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc61Q3UJV1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms