Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp6Q3U6U5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp6Q3U6U5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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