Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmf1Q3U3R4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms