Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud5Q3U2S4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms