Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms