Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem35bQ3U0Y2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem35bQ3U0Y2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms