Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms