Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc27Q3TKY6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms