Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riiad1Q3KNY5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms