Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cers3Q1A3B0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cers3Q1A3B0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms