Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms