Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms