Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kndc1Q0KK55 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms