Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms