Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc7a1Q09143 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc7a1Q09143 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms