Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms