Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms