Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms