Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk18Q04899 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk18Q04899 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdk18Q04899 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk18Q04899 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms