Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms