Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kcnb1Q03717 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnb1Q03717 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcnb1Q03717 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcnb1Q03717 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms